Dopo svariate ricerche perse tra installazioni di tool trial, ho finalmente trovato un software obfuscator gratuito per .NET
Si tratta di un progetto su Codeplex chiamato Confuser.
Lo trovate a questo indirizzo.
Ovviamente per vedere il risultato del lavoro avrete bisognodi un decompilatore.
In questo caso consiglio ILSpy, soluzione gratuita.